В ПИШ Новосибирского государственного университета (НГУ) разработали приложение OligoDesigner. Программа поможет онкологическим центрам или молекулярно-диагностическим лабораториям выявлять мутации в опухолевых клетках конкретного пациента за счет формирования уникальных панелей для персонализированной диагностики и терапии.
В результате работы OligoDesigner формируется готовый файл с последовательностями нуклеиновых кислот (короткими цепочками ДНК), которые передаются в лаборатории для синтеза. Такой подход позволит снизить стоимость анализов и сделать их доступными для широкого круга пользователей, а также формировать уникальные NGS-панели для персонализированной диагностики и подбора эффективной терапии.
Также OligoDesigner может быть использована для улучшения существующих панелей путем добавления в них новых последовательностей ДНК. Это поможет расширить список генов, которые анализируются в тесте, и повысить точность диагностики. В будущем планируется добавить модуль для автоматического обучения программы, повышающий точность секвенирования и диагностики.
Федеральный проект «Передовые инженерные школы» реализуется в рамках государственной программы Российской Федерации «Научно-технологическое развитие Российской Федерации».